Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NfascQ810U3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms