Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Liat1Q810M6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms