Protein–RNA interactions for Protein: Q810A3

Ttc9c, Tetratricopeptide repeat protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9cQ810A3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Ttc9cQ810A3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9cQ810A3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9cQ810A3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc9cQ810A3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Ttc9cQ810A3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9cQ810A3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ttc9cQ810A3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9cQ810A3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ttc9cQ810A3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ttc9cQ810A3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ttc9cQ810A3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ttc9cQ810A3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ttc9cQ810A3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ttc9cQ810A3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ttc9cQ810A3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ttc9cQ810A3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ttc9cQ810A3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ttc9cQ810A3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9cQ810A3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms