Protein–RNA interactions for Protein: Q80YF6

Upk3b, Uroplakin-3b, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3bQ80YF6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk3bQ80YF6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms