Protein–RNA interactions for Protein: Q80XI4

Pip4k2b, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4k2bQ80XI4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pip4k2bQ80XI4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pip4k2bQ80XI4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pip4k2bQ80XI4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pip4k2bQ80XI4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pip4k2bQ80XI4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pip4k2bQ80XI4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pip4k2bQ80XI4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pip4k2bQ80XI4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pip4k2bQ80XI4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms