Protein–RNA interactions for Protein: Q80WM4

Hapln4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln4Q80WM4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hapln4Q80WM4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hapln4Q80WM4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms