Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ell3Q80VR2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ell3Q80VR2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms