Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cfap100Q80VN0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cfap100Q80VN0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cfap100Q80VN0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cfap100Q80VN0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cfap100Q80VN0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cfap100Q80VN0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cfap100Q80VN0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cfap100Q80VN0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cfap100Q80VN0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Cfap100Q80VN0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cfap100Q80VN0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cfap100Q80VN0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cfap100Q80VN0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cfap100Q80VN0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cfap100Q80VN0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cfap100Q80VN0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms