Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ7

Rab3gap1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap1Q80UJ7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab3gap1Q80UJ7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
Rab3gap1Q80UJ7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab3gap1Q80UJ7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms