Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

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Length 2,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Arhgef17Q80U35 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgef17Q80U35 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Arhgef17Q80U35 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgef17Q80U35 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgef17Q80U35 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Arhgef17Q80U35 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Arhgef17Q80U35 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgef17Q80U35 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Arhgef17Q80U35 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Arhgef17Q80U35 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Arhgef17Q80U35 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgef17Q80U35 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgef17Q80U35 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgef17Q80U35 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arhgef17Q80U35 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arhgef17Q80U35 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arhgef17Q80U35 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arhgef17Q80U35 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Arhgef17Q80U35 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arhgef17Q80U35 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arhgef17Q80U35 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms