Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms