Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lamp3Q7TST5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lamp3Q7TST5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lamp3Q7TST5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lamp3Q7TST5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lamp3Q7TST5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp3Q7TST5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp3Q7TST5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp3Q7TST5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp3Q7TST5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp3Q7TST5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp3Q7TST5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp3Q7TST5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp3Q7TST5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp3Q7TST5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp3Q7TST5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp3Q7TST5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lamp3Q7TST5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lamp3Q7TST5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lamp3Q7TST5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lamp3Q7TST5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lamp3Q7TST5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lamp3Q7TST5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lamp3Q7TST5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lamp3Q7TST5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lamp3Q7TST5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lamp3Q7TST5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lamp3Q7TST5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lamp3Q7TST5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lamp3Q7TST5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lamp3Q7TST5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms