Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc93Q7TQK5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms