Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ShprhQ7TPQ3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ShprhQ7TPQ3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms