Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zfp397Q7TNK4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zfp397Q7TNK4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zfp397Q7TNK4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zfp397Q7TNK4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zfp397Q7TNK4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zfp397Q7TNK4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zfp397Q7TNK4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zfp397Q7TNK4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zfp397Q7TNK4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Zfp397Q7TNK4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zfp397Q7TNK4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zfp397Q7TNK4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zfp397Q7TNK4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zfp397Q7TNK4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zfp397Q7TNK4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zfp397Q7TNK4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zfp397Q7TNK4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Zfp397Q7TNK4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zfp397Q7TNK4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zfp397Q7TNK4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Zfp397Q7TNK4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Zfp397Q7TNK4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Zfp397Q7TNK4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Zfp397Q7TNK4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Zfp397Q7TNK4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Zfp397Q7TNK4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Zfp397Q7TNK4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Zfp397Q7TNK4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Zfp397Q7TNK4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Zfp397Q7TNK4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Zfp397Q7TNK4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Zfp397Q7TNK4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms