Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd1l2Q7TN88 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms