Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Shq1Q7TMX5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Shq1Q7TMX5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Shq1Q7TMX5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Shq1Q7TMX5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Shq1Q7TMX5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Shq1Q7TMX5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Shq1Q7TMX5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Shq1Q7TMX5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Shq1Q7TMX5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Shq1Q7TMX5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Shq1Q7TMX5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Shq1Q7TMX5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Shq1Q7TMX5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Shq1Q7TMX5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Shq1Q7TMX5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Shq1Q7TMX5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Shq1Q7TMX5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Shq1Q7TMX5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Shq1Q7TMX5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Shq1Q7TMX5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Shq1Q7TMX5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Shq1Q7TMX5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Shq1Q7TMX5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Shq1Q7TMX5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Shq1Q7TMX5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Shq1Q7TMX5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Shq1Q7TMX5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Shq1Q7TMX5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Shq1Q7TMX5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Shq1Q7TMX5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Shq1Q7TMX5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Shq1Q7TMX5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Shq1Q7TMX5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Shq1Q7TMX5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Shq1Q7TMX5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
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