Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Vma21Q78T54 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Vma21Q78T54 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vma21Q78T54 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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