Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms