Protein–RNA interactions for Protein: Q78J03

Msrb2, Methionine-R-sulfoxide reductase B2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb2Q78J03 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msrb2Q78J03 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msrb2Q78J03 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msrb2Q78J03 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msrb2Q78J03 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msrb2Q78J03 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msrb2Q78J03 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msrb2Q78J03 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msrb2Q78J03 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Msrb2Q78J03 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msrb2Q78J03 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msrb2Q78J03 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msrb2Q78J03 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Msrb2Q78J03 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msrb2Q78J03 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msrb2Q78J03 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msrb2Q78J03 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msrb2Q78J03 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msrb2Q78J03 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msrb2Q78J03 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msrb2Q78J03 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msrb2Q78J03 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msrb2Q78J03 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msrb2Q78J03 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms