Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Higd1cQ76I25 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Higd1cQ76I25 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Higd1cQ76I25 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Higd1cQ76I25 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Higd1cQ76I25 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Higd1cQ76I25 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Higd1cQ76I25 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Higd1cQ76I25 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Higd1cQ76I25 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Higd1cQ76I25 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Higd1cQ76I25 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Higd1cQ76I25 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Higd1cQ76I25 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Higd1cQ76I25 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Higd1cQ76I25 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Higd1cQ76I25 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Higd1cQ76I25 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Higd1cQ76I25 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Higd1cQ76I25 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Higd1cQ76I25 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Higd1cQ76I25 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Higd1cQ76I25 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Higd1cQ76I25 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Higd1cQ76I25 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms