Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ7

Spcs3, Signal peptidase complex subunit 3, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spcs3Q6ZWQ7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spcs3Q6ZWQ7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spcs3Q6ZWQ7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spcs3Q6ZWQ7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
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Spcs3Q6ZWQ7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Spcs3Q6ZWQ7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Spcs3Q6ZWQ7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Spcs3Q6ZWQ7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Spcs3Q6ZWQ7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Spcs3Q6ZWQ7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Spcs3Q6ZWQ7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Spcs3Q6ZWQ7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spcs3Q6ZWQ7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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