Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Syne2Q6ZWQ0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms