Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp34Q6ZQ93 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp34Q6ZQ93 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp34Q6ZQ93 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms