Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf653Q6YND2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms