Protein–RNA interactions for Protein: Q6XJV4

Cd200r4, Cell surface glycoprotein CD200 receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200r4Q6XJV4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd200r4Q6XJV4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd200r4Q6XJV4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms