Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M2Q6W9L1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M2Q6W9L1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms