Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc88cQ6VGS5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc88cQ6VGS5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms