Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp8b3Q6UQ17 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp8b3Q6UQ17 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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