Protein–RNA interactions for Protein: Q6UGQ3

Scgb2b2, Secretoglobin family 2B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb2b2Q6UGQ3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scgb2b2Q6UGQ3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scgb2b2Q6UGQ3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scgb2b2Q6UGQ3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scgb2b2Q6UGQ3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scgb2b2Q6UGQ3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scgb2b2Q6UGQ3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scgb2b2Q6UGQ3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scgb2b2Q6UGQ3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scgb2b2Q6UGQ3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms