Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HjurpQ6PG16 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HjurpQ6PG16 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms