Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup98Q6PFD9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup98Q6PFD9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms