Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms