Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trak1Q6PD31 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trak1Q6PD31 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms