Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms