Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6J4

Alkbh2, DNA oxidative demethylase ALKBH2, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh2Q6P6J4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Alkbh2Q6P6J4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms