Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Sik3Q6P4S6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sik3Q6P4S6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sik3Q6P4S6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms