Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ptpdc1Q6NZK8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms