Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZA9

Taf9b, Transcription initiation factor TFIID subunit 9B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf9bQ6NZA9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf9bQ6NZA9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms