Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Szrd1Q6NXN1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Szrd1Q6NXN1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms