Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpsf6Q6NVF9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms