Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg16l2Q6KAU8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg16l2Q6KAU8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms