Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CltbQ6IRU5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CltbQ6IRU5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms