Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Krt77Q6IFZ6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Krt77Q6IFZ6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt77Q6IFZ6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Krt77Q6IFZ6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Krt77Q6IFZ6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Krt77Q6IFZ6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Krt77Q6IFZ6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms