Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scaf8Q6DID3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms