Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Cep170Q6A065 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cep170Q6A065 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Cep170Q6A065 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms