Protein–RNA interactions for Protein: Q6A037

N4bp1, NEDD4-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp1Q6A037 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
N4bp1Q6A037 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
N4bp1Q6A037 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
N4bp1Q6A037 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
N4bp1Q6A037 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
N4bp1Q6A037 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
N4bp1Q6A037 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
N4bp1Q6A037 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
N4bp1Q6A037 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
N4bp1Q6A037 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
N4bp1Q6A037 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
N4bp1Q6A037 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
N4bp1Q6A037 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
N4bp1Q6A037 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
N4bp1Q6A037 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
N4bp1Q6A037 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
N4bp1Q6A037 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
N4bp1Q6A037 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
N4bp1Q6A037 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
N4bp1Q6A037 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
N4bp1Q6A037 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
N4bp1Q6A037 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
N4bp1Q6A037 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
N4bp1Q6A037 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
N4bp1Q6A037 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
N4bp1Q6A037 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
N4bp1Q6A037 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
N4bp1Q6A037 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
N4bp1Q6A037 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
N4bp1Q6A037 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
N4bp1Q6A037 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
N4bp1Q6A037 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms