Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Jmjd1cQ69ZK6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms