Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp4Q68FH0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms