Protein–RNA interactions for Protein: Q68FF6

Git1, ARF GTPase-activating protein GIT1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Git1Q68FF6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Git1Q68FF6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Git1Q68FF6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms